Differenza tra RNASE A e RNASE H

Differenza chiave - RNASE A vs RNASE H
 

Le ribonucleasi sono nucleasi che degradano specificamente l'RNA in unità più piccole. Possono essere divisi in due categorie; endoribonucleasi ed esoribonucleasi. L'endoribonucleasi è un'endonucleasi che può degradare l'RNA a singolo filamento o a doppio filamento. Scinde i legami fosfodiestere all'interno di una catena polinucleotidica RNA. Gli esempi sono RNase A, RNase III, RNase T1, RNase P e RNase H. Exoribonuclease è un esonucleasi che degradava l'RNA rimuovendo nucleotidi terminali da 5'end o 3'end della molecola di RNA. Gli esempi sono RNase R, RNase II, RNase D e RNase PH. Il differenza fondamentale tra RNASE A e RNASE H è quello RNase A è una ribonucleasi pancreatica che degrada in modo specifico l'RNA a filamento singolo in componenti più piccoli mentre RNase H è un enzima non specifico che scinde l'RNA nell'ibrido RNA-DNA in unità più piccole attraverso il meccanismo idrolitico.

CONTENUTO

1. Panoramica e differenza chiave
2. Cos'è RNASE A
3. Cos'è RNASE H
4. Somiglianze tra RNASE A e RNASE H
5. Confronto affiancato - RNASE A vs RNASE H in forma tabulare
6. Sommario

Cos'è RNASE A?

La RNasi A è una ribonucleasi pancreatica che scinde specificamente i residui di citosina e uracile spaiati all'estremità 3 'dell'RNA a filamento singolo. RNase H lavora a una concentrazione di sale più alta (0,3 M o più alta concentrazione di NaCl). La reazione idrolitica è di due passi. Forma un prodotto fosforilato 3 'tramite intermedio ciclico monofosfato 2', 3 '. Sebbene sia specifico per l'RNA a filamento singolo a una maggiore concentrazione di sali, può anche degradare RNA a doppio filamento e RNA nell'ibrido RNA-DNA a una concentrazione inferiore di NaCl (inferiore a 0,3 M NaCl).

Bruce Merrifield ha prima sintetizzato questo enzima. RNase A è un enzima molto popolare nella ricerca molecolare. RNasi A pancreatica bovina è un esempio di RNasi A. Ed è uno degli enzimi più duri che vengono utilizzati in laboratorio. Questo enzima non ha bisogno di un cofattore per la sua attività. È un enzima altamente termostabile. RNase A è il primo enzima e la terza proteina a cui è stata rilevata una sequenza aminoacidica corretta. Questo enzima è molto piccolo con 124 amminoacidi e massa molecolare di 12600da. E ha quattro residui di istidina (i suoi 12 e i suoi 119 che coinvolgono in reazione catalitica).

Figura 01: RNase A

RNase A può essere isolato facendo bollire un campione grezzo. Quando bolle, tutti gli altri enzimi degradano RNase A. Rnase A è un enzima incredibilmente stabile. Questo enzima inibisce con la proteina inibitore della ribonucleasi, metalli pesanti e complessi di vanadio uridina.

Che cos'è RNase H?

L'RNasi H è un enzima ribonucleasi non specifico che può degradare l'RNA nell'ibrido RNA-DNA tramite reazione idrolitica. L'RNasi H scinde il 3'- il legame O-P dell'RNA in un ibrido RNA-DNA. Alla fine produce 3'OH e 5 'prodotti terminati con fosfato. Nella replicazione del DNA svolge un ruolo fondamentale rimuovendo il primer RNA dopo la formazione di nuovi filamenti di DNA. In condizioni di laboratorio, degrada specificamente l'RNA nell'ibrido RNA-DNA ma non il DNA e l'RNA non ibridato. E questo enzima viene solitamente usato per distruggere il modello di RNA dopo che il primo filamento di DNA complementare si è formato durante la sintesi del cDNA.

Figura 02: RNase H

RNase H utilizza anche in saggi di protezione nucleasi. Può anche essere incorporato alla rimozione della coda di poli A dall'mRNA. RNase H ha la capacità di distruggere l'RNA non codificante all'interno e all'esterno della cellula. Gli ioni metallici sono necessari come cofattori per questa attività proteica. Un chelatore (EDTA) può essere usato per inibire l'enzima RNasi H.

Quali sono le somiglianze tra RNASE A e RNASE H?

• Entrambi sono proteine ​​in natura.
• Entrambi sono endoribonucleasi
• Entrambi possono degradare l'RNA.
• Entrambi eseguono reazioni idrolitiche.
• I laboratori molecolari usano entrambi questi.

Qual è la differenza tra RNASE A e RNASE H?

RNASE A vs RNASE H
RNasi A è una ribonucleasi pancreatica che fende specificatamente l'estremità 3 'di residui di citosina e uracile non reticolato di RNA a filamento singolo a concentrazione di sale più elevata.	RNasi H è un enzima ribonucleasi non specifico che può degradare l'RNA nell'ibrido RNA-DNA tramite reazione idrolitica.
Natura di RNA Cleaving
RNase A scinde specificamente l'RNA a filamento singolo a una maggiore concentrazione di sale.	RNase H scinde l'RNA nell'ibrido RNA-DNA.
Bisogno di co-fattori per l'attività
RNase A non ha bisogno di cofattori per la sua attività.	RNase H ha bisogno di ioni metallici come cofattori per la sua attività.
Inibitori dell'attività proteica
Proteina di inibitore della ribonucleasi, metalli pesanti e complessi di vanadio uridinico inibiscono l'attività di RNAse A.	Un chelatore (EDTA) inibisce l'attività di RNasi H..
RNA Primer Removal in Replica del DNA
RNase A non viene utilizzato per la rimozione del primer RNA nella replicazione del DNA.	RNase H è usato per la rimozione del primer RNA nella replicazione del DNA
Rimozione del modello di DNA nella sintesi del DNA complementare (C-DNA)
RNase A non viene utilizzato per la rimozione del template RNA durante la sintesi del DNA complementare (C-DNA).	RNase H è usato per la rimozione del template RNA durante la sintesi del DNA complementare (C-DNA).
Rimozione di Poly-A-Tail in mRNA ibridato a Oligo (dt)
RNase A non viene utilizzato per rimuovere "poly-A tail" in mRNA ibridato in oligo (dt).	RNase H è usato per rimuovere "poly-A tail" in mRNA ibridato in oligo (dt)

Sommario - RNASE A vs RNASE H

Le ribonucleasi sono enzimi nucleasi che hanno la capacità di scindere l'RNA in unità più piccole. Sono due tipi; endoribonucleasi ed esoribonucleasi. L'endoribonucleasi è un'endonucleasi che ha la capacità di degradare l'RNA a singolo filamento o a doppio filamento. E fende il legame fosfodiestere all'interno di una catena polinucleotidica RNA. RNAsi A e RNasi H sono due endoribonucleasi. L'RNAsi A è una ribonucleasi pancreatica che separa specificamente i residui di citosina e uracile a 3 'all'estremità dell'RNA a filamento singolo a una concentrazione di sale più elevata. RNasi H è un enzima ribonucleasi non specifico che può degradare l'RNA nell'ibrido RNA-DNA tramite reazione idrolitica. Questa è la differenza tra RNase A e RNase H.

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Riferimento:

1.Karuturi, autore Amrutha. "17 devono sapere i fatti su RNase A." Blog di AG, 22 febbraio 2017. Disponibile qui
2. "Ribonucleasi". Wikipedia, Wikimedia Foundation, 5 gennaio 2018. Disponibile qui  

Cortesia dell'immagine:

1.'RNase A'By Nessun autore leggibile dalla macchina fornito. Vossman ipotizzato (in base alle rivendicazioni sul copyright)., (CC BY-SA 2.5) attraverso Commons Wikimedia
2. 'RNase H fix'By Nessun autore leggibile dalla macchina fornito. Vossman ipotizzato (in base alle rivendicazioni sul copyright)., (CC BY-SA 2.5) attraverso Commons Wikimedia