Differenza tra minisatellite e microsatellite

Differenza chiave - Minisatellite vs Microsatellite
 

Il DNA ripetitivo è le sequenze nucleotidiche che si ripetono più e più volte nel genoma degli organismi. Il DNA ripetitivo rappresenta una frazione significativa del DNA genomico e ci sono tre tipi principali chiamati ripetizioni in tandem, ripetizioni terminali e ripetizioni intervallate. Le ripetizioni in tandem sono le sequenze altamente ripetute che si trovano adiacenti l'una all'altra senza interruzione. Ci sono tre principali tipi di ripetizioni in tandem nel genoma dei vertebrati. Sono DNA satellite, DNA microsatellite e DNA minisatellite. Minisatellite è una sezione di DNA altamente ripetuto che consiste in una serie di una sequenza ripetitiva composta da 10 a 100 coppie di basi. Il microsatellite è una sezione di DNA ripetitivo che consiste in sequenze brevi ripetute composte da 1 a 9 coppie di basi. Pertanto, la differenza chiave tra minisatellite e microsatellite è la dimensione o la lunghezza della sequenza ripetuta.

CONTENUTO

1. Panoramica e differenza chiave
2. Cos'è un Minisatellite
3. Cos'è un microsatellite
4. Somiglianze tra minisatellite e microsatellite
5. Confronto affiancato - Minisatellite vs Microsatellite in forma tabulare
6. Sommario

Cos'è un Minisatellite?

Il DNA minisatellite è una sezione di DNA che comprende una serie di sequenze ripetitive di DNA corte che è compresa tra 10 e 60 coppie di basi. Si parla anche di minisatelliti ripetizioni in tandem a numero variabile (VNTR). I minisatelliti sono spesso confusi con i microsatelliti. Tuttavia, minisatelliti e microsatelliti sono ora distinti in base alle dimensioni della sequenza ripetuta degli scienziati.

I minisatelliti possono essere visti in più di 1000 punti nel genoma umano. Queste brevi sequenze sono ricche di G e C. Il numero di ripetizioni in un dato minisatellite varia ampiamente tra gli individui.

Il primo minisatellite umano fu identificato da A. R. Wyman e R. White nel 1980. Successivamente, Alec Jeffreys scoprì l'estremo polimorfismo del numero di copie dei minisatelliti tra gli organismi. Queste scoperte fecero dei minisatelliti come indicatori ideali per il fingerprinting del DNA, l'analisi del linkage e gli studi sulla popolazione. I minisatelliti contribuiscono anche alla regolazione dell'espressione genica, della trascrizione, dello splicing alternativo, ecc.

Cos'è un microsatellite?

Il microsatellite è una sezione del DNA che ha ripetizioni di sequenza semplici da 1 a 10 coppie di basi. I microsatelliti sono anche chiamati brevi ripetizioni di sequenza (SSR) o semplici ripetizioni in tandem (STR).  Esistono due tipi di microsatelliti chiamati microsatelliti semplici e microsatelliti compositi. I microsatelliti semplici consistono in un solo tipo di sequenze ripetute. I microsatelliti compositi consistono in più di un tipo di ripetizioni. I microsatelliti possiedono in genere regioni poli A / T. I microsatelliti sono codominanti e abbondanti nei genomi eucariotici.

Simile ai minisatelliti, i microsatelliti mostrano anche il polimorfismo tra gli individui. Il numero di ripetizioni per un dato microsatellite varia tra gli individui. Pertanto, i microsatelliti possono anche essere usati come marcatori genetici nel fingerprinting del DNA. Il polimorfismo dei microsatelliti può essere facilmente identificato mediante PCR e elettroforesi su gel. La regione fiancheggiante del microsatellite è altamente conservata nelle specie correlate.

Quali sono le somiglianze tra minisatellite e microsatellite?

• Minisatelliti e microsatelliti sono sequenze di DNA non codificanti.
• Entrambe sono ripetizioni in tandem.
• Entrambi consistono in sequenze altamente ripetitive.
• Entrambi possono essere usati come potenti marcatori genetici per l'impronta digitale del DNA.

Qual è la differenza tra minisatellite e microsatellite?

Minisatellite vs Microsatellite
I minisatelliti sono ripetizioni in tandem con una lunghezza di ripetizione del monomero da 10 a 100 coppie di basi.	I microsatelliti sono brevi ripetizioni in tandem composte da 1 a 9 coppie di basi che ripetono le sequenze monomeriche.
Dimensione della sequenza ripetuta
Minisatellite ha sequenze ripetute da 10 a 100 coppie di basi.	Il microsatellite ha brevi sequenze da 1 a 9 coppie di basi.
Basi comuni
I minisatelliti sono ricchi di basi G e C.	I microsatelliti sono ricchi di basi A e T.
Altri nomi
I minisatelliti sono anche noti come ripetizioni in tandem a numero variabile (VNTR).	I microsatelliti sono anche noti come ripetizioni a sequenza breve (SSR) o semplici ripetizioni in tandem (STR).

Sommario - Minisatellite vs Microsatellite

Minisatellite e microsatellite sono due tipi di ripetizioni in tandem. Si distinguono in base al numero di basi nella sequenza ripetuta o alla dimensione della sequenza. Minisatellite ha una sequenza ripetitiva di lunghezza da 10 a 100 coppie di basi, mentre il microsatellite ha una sequenza ripetitiva di lunghezza da 1 a 9 coppie di basi. Questa è la principale differenza tra minisatellite e microsatellite. Il numero di copie della sequenza ripetitiva in minisatelliti e microsatelliti varia ampiamente tra gli individui. Sia i minisatelliti che i microsatelliti sono potenti marcatori del DNA per analizzare la variazione genetica all'interno e tra popolazioni di specie.

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Riferimenti:

1.Haneef, Deena T Kochunni Jazir. "Differenze principali." Differenza tra minisatellite e microsatellite. N., n. web. Disponibile qui. 06 luglio 2017.
2. Viira, Maria Lucia Carneiro, Luciane Santini, Augusto Lima Diniz e Carla De Freitas Munhoz. "Marcatori microsatelliti: cosa significano e perché sono così utili." Genetica e biologia molecolare. Sociedade Brasileira de Genética, 2016. Web. Disponibile qui. 07 luglio 2017.

Cortesia dell'immagine:

1. "VNTRexample" di Madelyndotson - Opera propria (CC BY-SA 4.0) tramite Commons Wikimedia