Differenza tra Cosmico e Fagemide

Il differenza fondamentale tra Cosmid e Phagemid è sul tipo di sequenze che contiene. Un Cosmid contiene un sito cos e un plasmide. Pertanto, è un vettore ibrido mentre un Fagemide è un plasmide che contiene un'origine F1 di replicazione del fago F1.

I cosmidi e i fagemidi sono usati per scopi di clonazione, specialmente per clonare più grandi frammenti di DNA. Questi sono ampiamente usati soprattutto nei geni di clonazione responsabili della produzione di varie proteine. I cosmidi e i fagemidi sono replicati da soli come plasmidi o sono impacchettati in particelle virali e quindi replicati.

CONTENUTO

1. Panoramica e differenza chiave
2. Cos'è un Cosmid
3. Cos'è un Fagemide
4. Somiglianze tra Cosmid e Phagemid
5. Confronto fianco a fianco - Cosmico vs Fagemide in forma tabulare
6. Sommario

Cos'è un Cosmid?

Un Cosmid, indicato come un plasmide ibrido, comprende siti di coseno estratti da particelle di fago Lambda e un plasmide. Questi siti cos sono lunghi frammenti di DNA con 200 basi. Quindi, hanno estremità coesive o appiccicose che permettono al plasmide di adattarsi al DNA virale. Pertanto, i siti cos sono vitali per il confezionamento del DNA.

Ci sono tre siti cos;

  • sito cosN - coinvolto nel troncare il filamento del DNA con l'attività della terminasi
  • sito COSB - impegnato a mantenere il termine.
  • sito cosQ - coinvolto nella prevenzione del degrado del DNA da parte dei DNasi.

Figura 01: Cosmico

Inoltre, i Cosmetic possono replicare DNA a filamento singolo o DNA a doppio filamento utilizzando un'adeguata origine di replicazione. I cosmetici di solito contengono geni di resistenza agli antibiotici come marcatori per la selezione dei trasformanti. Quindi, l'uso di un cosmide come vettore può facilitare la clonazione e la digestione enzimatica di restrizione del vettore può quindi estrarre questi frammenti.

Cos'è un Fagemide (phasmid)?

Fagemide, anche definito come phasmid, è anche un tipo di vettore ibrido. Il fagemide contiene un'origine speciale di replicazione definita come l'origine f1 della replicazione. L'origine f1 della replicazione estrae da un fago f1.

Il fagemide può replicare sia il DNA a singolo filamento che a doppio filamento. La replicazione può avvenire come un plasmide mentre si sottopone a replicazione indipendente o può essere impacchettata in particelle di fago e infine infettare l'ospite batterico E coli. Quando si infetta il E coli cellule, il fago f1 richiede la presenza di un pilus. Quindi, i pili del sesso sono importanti durante in vitro confezione di Fagemidi.

Quali sono le somiglianze tra Cosmid e Phagemid?

  • Sia Cosmid che Phagemid sono vettori di clonazione utilizzati nella tecnologia del DNA ricombinante.
  • Cosmid e Phagemid possono replicare il DNA a singolo filamento ea doppio filamento.
  • Entrambi possono essere sottoposti a replicazione indipendente simile ai plasmidi.
  • Cosmid e Phagemid possono subire in vitro Imballare e infettare le cellule batteriche.
  • Sia Cosmid che Phagemid richiedono un'adeguata origine di replicazione per la clonazione.

Qual è la differenza tra Cosmid e Phagemid?

Cosmico vs Fagemide

Cosmid è un vettore ibrido che contiene un sito cos e un plasmide. Il fagemide è un plasmide che contiene un'origine F1 di replicazione del fago F1.
 Presenza di siti Cos
I siti Cos sono presenti in cosmid e sono necessari per gli imballaggi in vitro. I siti Cos sono assenti in fagemidi.
 Presenza di F1 Origine della replica
In cosmica, l'origine della replicazione può o non può presentarsi. L'origine F1 della replicazione è presente nel fagemide.
Presenza di geni resistenti agli antibiotici
I geni resistenti agli antibiotici sono presenti nei cosmidi per identificare i trasformanti da non trasformanti. I geni resistenti agli antibiotici sono assenti nei fagemidi.
Requisiti dell'imballaggio in vitro
Richiede un sito cos. Richiede un pilus sessuale.

Sommario - Cosmico vs fagemidi

Cosmid e Phagemid sono vettori di clonazione utilizzati nella tecnologia del DNA ricombinante. I cosmidi sono vettori ibridi che contengono estremità appiccicose speciali noti come siti cos. in vitro l'imballaggio richiede questi siti cos. Mentre i fagemidi sono plasmidi che contengono una origine f1 di replicazione estratta dal fago f1. Sia il cosmideo che il fagemide possono essere sottoposti a replicazione indipendente o in vitro imballaggio alle cellule batteriche. Queste sono le importanti differenze tra cosmico e fagemide.

Riferimento:

1.Qi, H, et al. "Vettori phagemid per la visualizzazione dei fagi: proprietà, caratteristiche e costruzione". Journal of Molecular Biology., U.S. National Library of Medicine, 30 marzo 2012. Disponibile qui 
2. Collins, J e B Hohn. "Cosmidi: un tipo di plasmide Gene-Cloning Vector che è confezionabile in vitro in teste di Lambda di batteriofagi". Atti della National Academy of Sciences degli Stati Uniti d'America, Biblioteca Nazionale di Medicina degli Stati Uniti, settembre 1978. Disponibile qui  

Cortesia dell'immagine:

1. 'Cmid (inglese)' di Zlir'a (CC0) via Commons Wikimedia