Differenza tra rRNA 16s e rDNA 16s

Differenza chiave - 16s rRNA vs rsNA 16s
 

I ribosomi sono i siti biologici della sintesi proteica in tutti gli organismi viventi. I ribosomi contengono due componenti; piccola subunità e una grande subunità. Gli organismi procarioti e gli organismi eucarioti differiscono dalla composizione dei ribosomi che contengono. Ogni subunità è composta da RNA ribosomiale e diverse proteine. Queste due subunità si adattano e funzionano come una sola durante la sintesi proteica. I ribosomi procariotici sono gli anni '70 e sono composti da subunità 30S e subunità 50S di grandi dimensioni. I ribosomi eucariotici sono 80S e sono composti da subunità 40S e subunità 60S di grandi dimensioni. Nei procarioti, l'RNA ribosomiale della piccola subunità di ribosomi è noto come rRNA 16s. Questo rRNA 16s è trascritto dal DNA cromosomico che è noto come rDNA 16s. L'rDNA 16s è il gene che produce l'rRNA 16s mediante la trascrizione. Il differenza fondamentale tra l'rRNA 16s e il rDNA 16s è quello L'rRNA 16s è l'RNA ribosomico a filamento singolo trascritto che è un componente della piccola subunità dei procarioti mentre il rDNA 16s è il DNA cromosomico a doppio filamento o il gene che codifica per l'rRNA 16s.. Gene dell'RRNA 16s è il rDNA 16s.

CONTENUTO

1. Panoramica e differenza chiave
2. Cos'è l'rRNA 16s
3. Che cos'è rDNA 16s
4. Somiglianze tra rRNA 16s e rDNA 16s
5. Confronto fianco a fianco - rRNA 16s vs rDNA 16s in forma tabulare
6. Sommario

Cos'è l'rRNA 16s?

rRNA è un componente dei ribosomi. L'rRNA 16s è il componente specifico della piccola subunità 30S del ribosoma procariotico che si lega alla sequenza Shine-Dalgarno. Questa sequenza di rRNA 16s mostra un'elevata variabilità tra le specie batteriche. Quindi, può essere utilizzato per la filogenesi batterica e la tassonomia.

Che cos'è rDNA 16s?

I procarioti hanno ribosomi 70S. La piccola subunità dei ribosomi procarioti è il 30S. L'RNA ribosomiale (rRNA) della piccola subunità 30S è noto come rRNA 16s e il gene 16s rDNA lo codifica. Quindi rDNA 16s è noto come gene rRNA 16s. L'rDNA 16s è DNA cromosomico. È a doppio filamento ed è un gene composto da regioni codificanti e non codificanti. Quando il gene rDNA 16s viene trascritto, produce una sequenza di rRNA di 16 secondi. RDNA 16s è la sequenza universale del DNA nei procarioti. Tuttavia, la sequenza del rDNA 16s tra i procarioti varia. Facilita l'uso della sequenza di rDNA 16s nell'accurata identificazione delle specie batteriche e anche per la scoperta di nuove specie batteriche.

RDNA 16s svolge un ruolo importante nella filogenesi e nella tassonomia batterica. Pertanto, è usato come un marcatore molecolare affidabile negli studi filogenetici dei procarioti poiché è altamente conservato tra le diverse specie. La sequenza nucleotidica di rDNA 16 ha nove regioni ipervariabili (V1-V9) che forniscono una buona fonte per la differenziazione di batteri e archaea.

Figura 01: DNA e RNA

Il sequenziamento del gene rDNA 16s ha facilitato la riclassificazione dei batteri in nuove specie o generi. Quindi, questo gene viene utilizzato nei laboratori molecolari come marker di housekeeping più comune per l'identificazione dei microbi. Ci sono diversi motivi che hanno reso il 16srDNA il miglior marker per l'identificazione di microbi come la presenza di 16srDNA in tutti i batteri, la natura invariata della funzione del gene rDNA 16s nel tempo e le grandi dimensioni del rDNA 16s che lo rende abbastanza a scopo informativo.

Quali sono le somiglianze tra rRNA 16s e rDNA 16s?

  • Entrambi sono acidi nucleici.
  • Entrambi sono costituiti da nucleotidi.
  • Entrambi sono legati all'RNA ribosomiale.

Qual è la differenza tra rsNA 16s e rDNA 16s?

RRNA 16s vs rDNA 16s

L'rRNA 16s è il componente dell'RNA ribosomale della piccola subunità del ribosoma 30s dei procarioti. L'rDNA 16s è il DNA cromosomico che codifica per la sequenza di rRNA 16s dei procarioti.
 Numero di fili
L'rRNA 16s è a singolo filamento. L'rDNA 16s è a doppio filamento
Gene o sequenza
L'rRNA 16s è un RNA trascritto di un gene. L'rDNA 16s è un gene.
 Sequenza di codifica
L'rRNA 16s ha solo la sequenza di codifica. RDNA 16s ha entrambi i fili codificanti e non codificanti.
Base di Uracil
L'rRNA 16s contiene basi di uracile nella sua sequenza nucleotidica. L'rDNA 16s non contiene uracile di base nelle sue sequenze nucleotidiche.
Thymin Base
L'rRNA 16s non contiene basi di timina nella sua sequenza nucleotidica. L'rDNA 16s contiene basi di timina nelle sue sequenze nucleotidiche.
Sintesi
L'rRNA 16s è realizzato sulla trascrizione del gene rDNA 16s. RDNA 16s è nel genoma dei procarioti.

Riepilogo - 16s rRNA vs rsNA 16s 

L'rRNA 16s è il componente dell'RNA ribosomale della piccola subunità dei ribosomi dei procarioti. Il gene 16s rDNA codifica questa sequenza di RNA. L'rRNA 16s è single-stranded e il rDNA 16s è double-stranded. Questa è la differenza tra rsNA 16s e rDNA 16s.

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Riferimento:

1. Janda, J. Michael e Sharon L. Abbott. "Sequenziamento del gene rRNA 16S per l'identificazione batterica nel laboratorio diagnostico: vantaggi, pericoli e insidie". Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, Sept. 2007. Disponibile qui  
2. "Ribosoma". Wikipedia, Wikimedia Foundation, 13 gennaio 2018. Disponibile qui  
3.Woo, P C, et al. "Allora e ora: uso del sequenziamento del gene rDNA 16S per l'identificazione batterica e la scoperta di nuovi batteri nei laboratori di microbiologia clinica." Microbiologia clinica e infezione: la pubblicazione ufficiale della European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases., US National Library of Medicine , Ottobre 2008. Disponibile qui 

Cortesia dell'immagine:

1.'Differenza DNA RNA-EN 'di Sponk (talk) - strutture chimiche di nucleobasi di Roland1952, (CC BY-SA 3.0) attraverso Commons Wikimedia