Differenza tra proteomica mirata e non mirata

La differenza chiave tra la proteomica mirata e non mirata è che il la proteomica mirata punta a misurare l'abbondanza di una proteina specifica mentre la proteomica non mirata non mira a una proteina specifica.

La proteomica è lo studio su larga scala delle proteine, delle loro strutture e funzioni. Studia l'intero complemento proteico in una cellula, tessuto o un organismo in specifiche condizioni. Esistono due tipi di proteomica come proteomica mirata e proteomica non mirata.

SODDISFARE

1. Panoramica e differenza chiave
2. Cos'è la Proteomica Mirata
3. Cos'è la proteomica non mirata
4. Somiglianze tra proteomica mirata e non mirata
5. Confronto affiancato - Proteomica mirata vs non mirata in forma tabulare
6. Sommario

Cos'è la Proteomica Mirata?

Come indica il nome, la proteomica mirata si rivolge a una proteina specifica oa un peptide in una complessa miscela di proteine ​​per l'analisi. Quindi analizza la presenza e la quantità di quella proteina specifica preselezionata. Questo metodo è possibile solo per un campione o su più campioni. Questo metodo è adatto anche per un gruppo specifico di proteine. Risulta in dati più precisi, quantitativi e sensibili. Inoltre, la spettrometria di massa accoppiata con proteomica mirata produce misure affidabili più accurate. Questo metodo utilizza lo spettrometro di massa a triplo quadrupolo (QQQ) per la sua analisi.

Figura 01: Proteomica

La proteomica mirata è un metodo adatto se si desidera verificare se un target di knockdown viene effettivamente abbattuto o quando si desidera quantificare una particolare proteina / peptide nel siero di sangue, nel liquido cerebrale o nel lisato cellulare ecc. Puoi anche usarlo se vuoi per verificare se una particolare proteina è espressa in modo differenziale tra i campioni o durante un esperimento nel tempo.

Cos'è la proteomica non mirata?

La proteomica non mirata, come cita il nome, non ha come target una proteina o un peptide specifici per la sua analisi. Scoperta proteomica è un altro nome per la proteomica non mirata. In realtà, è un'analisi più "globale". In generale, l'esecuzione di proteomica non mirata è di rispondere alla domanda "quali proteine ​​o proteine ​​sono in questo campione o più campioni?". Questo metodo non è sensibile come proteomica mirata. Ma può identificare e misurare molte proteine ​​tra cui nuove proteine. La proteomica non mirata può produrre misurazioni sia quantitative che qualitative.

Quali sono le somiglianze tra proteomica mirata e non mirata?

• Sia la proteomica mirata che quella non mirata misurano le proteine ​​nei campioni.
• Sono importanti nell'analisi del proteoma.
• Questi metodi usano la spettrometria di massa.

Qual è la differenza tra proteomica mirata e non mirata?

In primo luogo, la proteomica mirata è la determinazione della presenza e della quantità di una particolare proteina o peptide in una complessa miscela di proteine. Al contrario, la proteomica non mirata è lo studio quantitativo e qualitativo delle proteine ​​presenti in un campione o campioni senza bersagliare una particolare proteina. La proteomica mirata viene eseguita con proteine ​​preselezionate o mirate mentre la proteomica non mirata viene eseguita per scoprire i tipi di proteine ​​in questo campione. Inoltre, la proteomica mirata è più sensibile della proteomica non mirata.

Riassunto - Proteomica mirata vs non mirata

Per riassumere, la proteomica mirata e non mirata sono due tipi di studi sulle proteine. Come suggerisce il loro nome, la proteomica mirata si rivolge a una proteina specifica mentre la proteomica non mirata non mira a una proteina specifica. Questa è la differenza tra proteomica mirata e non mirata.

Riferimento:

1. "Proteomica mirata." UC Davis Proteomics Core, Disponibile qui.
2. "Proteomica / Introduzione alla proteomica". Teoria musicale / modalità - Wikibooks, Open Books for an Open World, Disponibile qui.

Cortesia dell'immagine:

1. "Proteomics" di Xxl7441 in inglese Wikibooks - Trasferito da en.wikibooks a Commons (Public Domain) via Commons Wikimedia