Differenza tra sito attivo e sito vincolante

Il differenza fondamentale tra sito attivo e sito vincolante è quello un sito attivo aiuta la catalisi di una reazione chimica mentre un sito di legame aiuta il legame di un ligando ad una grande molecola.

Un sito di legame è una regione su una proteina, DNA o RNA, a cui può legarsi un ligando. Gli enzimi sono proteine. Un sito attivo è una regione su un enzima a cui i substrati possono legarsi per subire una reazione chimica. Questa regione specifica ha anche un sito di legame con un sito catalitico. Pertanto, i siti di legame aiutano solo nel legame di un ligando a una grande molecola, mentre i siti attivi aiutano sia il legame di un ligando a una molecola grande che mentre lo fanno subire una reazione chimica catalizzata.

CONTENUTO

1. Panoramica e differenza chiave
2. Cos'è il sito attivo
3. Cos'è il sito vincolante
4. Confronto affiancato - Sito attivo e sito vincolante in forma tabulare
5. Sommario

Cos'è il sito attivo?

Il sito attivo è una regione su un enzima a cui i substrati di una reazione chimica si legano per subire una reazione chimica catalizzata. questa regione è costituita da due sottoregioni come sito di legame e sito catalitico. Il sito di legame contiene alcuni residui che possono aiutare il legame del substrato (reagenti) sull'enzima. Il sito catalitico aiuta a catalizzare la reazione chimica. Inoltre, questa regione è molto piccola se confrontata con l'intero volume dell'enzima; circa il 10-20% dell'intero volume dell'enzima.

Figura 01: Sito vincolante e sito catalitico di un sito attivo

Di solito, il sito attivo contiene 3-4 aminoacidi. il resto degli aminoacidi nell'enzima coinvolto nel mantenimento della struttura terziaria dell'enzima. Ancora più importante, un sito attivo ha un design specifico che può adattarsi a un substrato specifico. Pertanto, questi enzimi reagiscono solo con particolari substrati. Ma a volte, gli enzimi hanno bisogno di cofattori per la loro funzione. La funzione principale del sito attivo è di ridurre l'energia di attivazione di una reazione chimica, in tal modo, per aumentare la velocità di reazione.

Cos'è il sito vincolante?

Il sito legante è una regione su una proteina, DNA o RNA a cui i ligandi possono legarsi. Lì, il ligando può formare un legame chimico con questo sito. Queste regioni mostrano specificità; un particolare ligando si legherà a un particolare sito di legame. Pertanto, questo sito è una misura dei tipi di ligandi che possono legarsi con una molecola.

Inoltre, usiamo spesso queste regioni per la caratterizzazione funzionale delle biomolecole. Ad esempio, possiamo caratterizzare la funzionalità di un sito attivo attraverso il suo sito di rilegatura. Inoltre, nel caso del DNA, il tipo specifico di sito di legame è il sito di legame del fattore di trascrizione presente sul DNA.

Qual è la differenza tra sito attivo e sito vincolante?

Il sito attivo è una regione su un enzima a cui i substrati di una reazione chimica si legano per subire una reazione chimica catalizzata mentre il sito di legame è una regione su una proteina, DNA o RNA, a cui i ligandi possono legarsi. Questa è la differenza chiave tra sito attivo e sito vincolante. Inoltre, i siti attivi sono presenti sugli enzimi e aiutano ad aumentare la velocità di reazione di una particolare reazione chimica diminuendo la barriera di energia di attivazione di quella reazione. I siti leganti, d'altra parte, sono responsabili per il legame di un ligando specifico con una particolare molecola.

L'infografica qui sotto presenta la differenza tra sito attivo e sito di legame in forma tabellare.

Riepilogo: sito attivo e sito vincolante

I siti attivi sono regioni su enzimi che possono aumentare la velocità di reazione di una reazione chimica riducendo la barriera energetica di attivazione di quella reazione. Un sito vincolante è una regione in cui un legante può legarsi. Il sito attivo contiene anche un sito di rilegatura. La differenza tra sito attivo e siti vincolanti si basa sull'esistenza e sulla funzionalità. Pertanto, la differenza chiave tra sito attivo e sito di legame è che un sito attivo aiuta la catalisi di una reazione chimica mentre un sito di legame aiuta il legame di un ligando a una grande molecola.

Riferimento:

1. "Sito attivo". Wikipedia, Wikimedia Foundation, 24 luglio 2018. Disponibile qui 
2. "Sito vincolante". Wikipedia, Wikimedia Foundation, 28 agosto 2018. Disponibile qui 

Cortesia dell'immagine:

1. "Struttura enzimatica" di Thomas Shafee - Opera propria, (CC BY 4.0) attraverso Commons Wikimedia